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发票已认证但是未申报抵扣怎么办
已认证的发票，应尽快申报抵扣，如发票核实过期，可联系税务机关进行补办，申报认证时需按照相关规定完成。如果不能补办，可以减免税款，减免税款的办法为：根据《中华人民共和国税收征收管理法》第七十六条的规定，当受税人无法提供纳税用的税务机关规定的税务发票、单据或其他证明时，可以减免税款。
发票已认证但是未申报抵扣：
增值税一般纳税人取得2010年1月1日以后开具的增值税专用发票、公路内河货物运输业统一发票、机动车销售统一发票以及海关缴款书，未在规定期限内到税务机关办理认证、申报抵扣或者申请稽核比对的，不得作为合法的增值税扣税凭证，不得计算进项税额抵扣。
根据《 国家税务总局 关于未按期申报抵扣增值税扣税凭证有关问题的公告》( 国家税务总局 公告2011年第78号)的规定，增值税一般纳税人取得的增值税专用发票已认证或已采集上报信息但未按照规定期限申报抵扣，属于发生真实交易且符合本公告第二条规定的客观原因的，经主管税务机关审核，允许纳税人继续申报抵扣其进项税额。增值税一般纳税人除本公告第二条规定的客观原因以外的其他原因造成增值税扣税凭证未按期申报抵扣的，仍按照现行增值税扣税凭证申报抵扣有关规定执行。
客观原因包括如下类型：
⑴因 自然灾害 、社会突发事件等不可抗力原因造成增值税扣税凭证未按期申报抵扣；
⑵有关司法、行政机关在办理业务或者检查中，扣押、封存纳税人账簿资料，导致纳税人未能按期办理申报手续；
⑶税务机关信息系统、网络故障，导致纳税人未能及时取得认证结果通知书或稽核结果通知书，未能及时办理申报抵扣；
⑷由于企业办税人员伤亡、突发危重疾病或者擅自离职，未能办理交接手续，导致未能按期申报抵扣；
⑸ 国家税务总局规定的其他情形。
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